Programa de Secuenciación Completa del Genoma | Fundación Síndrome de Dravet
El síndrome de Dravet (SD) es una encefalopatía epiléptica y del desarrollo (EED) grave, rara y compleja que afecta aproximadamente a 1 de cada 16.000 nacimientos. Con una tasa de mortalidad prematura del 15%, el SD se caracteriza por crisis epilépticas frecuentes resistentes a los fármacos antiepilépticos convencionales, deterioro cognitivo, psicomotor y del lenguaje, así como trastornos del comportamiento. Un diagnóstico precoz es esencial para un manejo adecuado de la enfermedad.
La secuenciación completa del genoma (WGS, por sus siglas en inglés) podría ser clave para la obtención del diagnóstico final del paciente. Un diagnóstico correcto evita pruebas innecesarias y facilita el tratamiento adecuado, lo cual supone una mejora de valor incalculable de su calidad de vida y la de toda la familia. Cuanto antes se consiga el diagnóstico, antes podrá aplicarse el tratamiento adecuado, lo cual podría alterar de manera positiva el rumbo de la enfermedad.
Objetivos
Las familias con un miembro no diagnosticado se enfrentan a un viaje incierto, conocido como la odisea del diagnóstico. Esta odisea conlleva años -ocho de media- de visitas al hospital, pruebas no concluyentes y tratamientos costosos, además de muchos efectos psicológicos. El objetivo del Programa WGS de la Fundación es contribuir a eliminar las barreras del diagnóstico genético en España, reducir el tiempo de diagnóstico del SD y patologías relacionadas, y descubrir nuevos factores genómicos que causan/afectan a esta enfermedad.
Muchos centros sanitarios en España no disponen de las instalaciones de secuenciación necesarias ni cuentan con expertos en genética clínica (de hecho, España es uno de los pocos países desarrollos que no cuenta oficialmente con tal especialidad) y la mayoría de los otros centros que ofrecen servicios de NGS suelen utilizar paneles de genes dirigidos/limitados, los cuales no son concluyentes para algunos pacientes. Además, el conocimiento y el acceso a estas tecnologías suelen ser escasos entre las familias. Con los enormes avances de las últimas dos décadas en las ciencias genómicas, y en comparación con otros tipos de pruebas, la WGS proporciona ahora una visión de alta resolución del genoma, base por base, que puede ser la clave para obtener el diagnóstico final del paciente.
Recursos
Los beneficiarios potenciales del Programa son aquellos pacientes de cualquier edad, residentes en España y atendidos por médicos y especialistas en centros y hospitales públicos del Sistema Nacional de Salud que presenten un cuadro clínico compatible con SD.
Para el correcto análisis de los resultados también se solicitan los términos HPO (Human Phenotype Ontology) y los datos farmacológicos de los pacientes. Para participar en el Programa, la solicitud del paciente debe ser emitida por el médico, que también es el encargado de tomar la muestra al paciente, y tiene que ir acompañada de un consentimiento informado firmado por el paciente o su representante legal.
La WGS se realiza en colaboración con un centro especializado en pruebas avanzadas de ADN, que realiza la extracción del ADN genómico de la saliva, la preparación de la genoteca y la secuenciación del genoma (100% de las regiones intergénicas e intragénicas cubiertas, 99,80% de sensibilidad). El análisis de los resultados lo realiza la Fundación en colaboración con expertos en genética clínica, realizando la priorización de variantes en los genes seleccionados en base a los términos HPO del paciente informados por el médico.
Resultados
Las variantes de significado incierto (VUS) se discutieron con los médicos de los pacientes tras la emisión del informe genético. Los médicos solicitantes eran, en general, neurólogos infantiles. Neurólogos de adultos, genetistas clínicos y médicos de cabecera también están solicitando este servicio. En resumen, el Programa WGS es un programa pionero de apoyo a la epilepsia rara, liderado por primera vez por una organización de pacientes, cuyo objetivo principal es acortar el tiempo de diagnóstico del SD y trastornos relacionados. De hecho, los casos aquí presentados tenían una edad media de 8 años, y un paciente pudo finalmente recibir un diagnóstico adecuado a los 22 años gracias al programa. Asimismo, se están identificando otras EED en pacientes incluidos en este Programa, además del SD.
La WGS favorece un diagnóstico preciso de las epilepsias raras, evitando pruebas innecesarias y, en última instancia, mejorando la calidad de vida del paciente y de toda su familia, así como facilita el acceso del paciente a las terapias adecuadas para su enfermedad concreta. Basándose en el éxito de su Programa, la Fundación está también liderando proyectos de investigación traslacional en colaboración con reconocidos investigadores internacionales.
Un 10, ánimo